Bioinformatik

Entstanden in der Vorbereitung auf die NF-Diplomprüfung Theoretische Biologie, orientiert sich das Skript sehr eng an der gleichnamigen Vorlesung von Prof. Hanspeter Herzel und Dr. Johannes Schuchardt an der HU Berlin.

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Skript (2.3 MB) [PS.GZ]

Inhalt

0. Einführung
1. Genidentifikation bei Prokaryoten, Sequenzstatistik
2. Konsensussequenzen, Gewichtsmatrizen
3. Einführung in die Informationstheorie
4. Eukaryotische Genidentifikation
5. Markov-Modelle, Wortentropien
6. Periodizitäten in DNA- und Proteinsequenzen
7. Heterogenität von Genomen: Repeats & Isochoren
8. Sequenzalignment
9. Stammbaumrekonstruktion